18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3453 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  256  7e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  91.27 
 
 
128 aa  226  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2397  PilT N-term./Vapc superfamily-like protein  66.94 
 
 
153 aa  149  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2208  rpo operon protein  62.3 
 
 
124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.968632  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0729  SSU processome protein Utp24  58.73 
 
 
125 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.857115 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2279  hypothetical protein  42.19 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000036024  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0246  nucleotide binding protein, PINc  39.32 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2862  nucleotide binding protein, PINc  31.09 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00180077  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2241  nucleotide binding protein, PINc  37.07 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0604  nucleotide binding protein, PINc  37.7 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  41.27 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1118  Protein of unknown function DUF652  31.97 
 
 
118 aa  52  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00355595  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  26.36 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0653  nucleotide binding protein PINc  23.48 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0587  nucleotide binding protein PINc  24.17 
 
 
131 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.579248  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0258  nucleotide binding protein, PINc  33.33 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000462302 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1989  PilT domain-containing protein  33.87 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>