12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0258 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0258  nucleotide binding protein, PINc  100 
 
 		 129 aa  254  3e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000462302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  37.82 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0923  PilT domain-containing protein  33.04 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.223217 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  36.52 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1614  PilT domain-containing protein  32.17 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2208  rpo operon protein  36.52 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.968632  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0896  PilT domain-containing protein  37.39 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.996154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1989  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  28.45 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0691  PilT domain-containing protein  26.92 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  22.22 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>