20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0286 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  243  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2279  hypothetical protein  61.16 
 
 		 122 aa  149  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000036024  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  51.24 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2208  rpo operon protein  41.67 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.968632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0604  nucleotide binding protein, PINc  38.4 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0729  SSU processome protein Utp24  44.17 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.857115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2862  nucleotide binding protein, PINc  34.68 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00180077  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2241  nucleotide binding protein, PINc  37.01 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2397  PilT N-term./Vapc superfamily-like protein  38.66 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  37.7 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  36.36 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1118  Protein of unknown function DUF652  31.36 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00355595  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0246  nucleotide binding protein, PINc  32.17 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  28.23 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0653  nucleotide binding protein PINc  28.8 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198585  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1989  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0587  nucleotide binding protein PINc  26.61 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.579248  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0258  nucleotide binding protein, PINc  28.45 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000462302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1614  PilT domain-containing protein  27.52 
 
 		 112 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1390  Nucleotide binding protein PINc  25 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>