16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2208 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2208  rpo operon protein  100 
 
 		 124 aa  242  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.968632  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  62.3 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  60.66 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2397  PilT N-term./Vapc superfamily-like protein  57.85 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0729  SSU processome protein Utp24  66.67 
 
 		 125 aa  123  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.857115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  41.67 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2279  hypothetical protein  42.74 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000036024  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  45.53 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2862  nucleotide binding protein, PINc  32.26 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00180077  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0604  nucleotide binding protein, PINc  38.84 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2241  nucleotide binding protein, PINc  40.52 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1118  Protein of unknown function DUF652  35.54 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00355595  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0246  nucleotide binding protein, PINc  36.52 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0258  nucleotide binding protein, PINc  36.52 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000462302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1614  PilT domain-containing protein  36 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  21.95 
 
 		 136 aa  40  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>