15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2241 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2241  nucleotide binding protein, PINc  100 
 
 		 126 aa  248  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0604  nucleotide binding protein, PINc  57.14 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0246  nucleotide binding protein, PINc  51.3 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2862  nucleotide binding protein, PINc  44 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00180077  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  41.6 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  40.52 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2208  rpo operon protein  40.52 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.968632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  37.01 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2279  hypothetical protein  34.92 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000036024  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  37.07 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2397  PilT N-term./Vapc superfamily-like protein  36.29 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1118  Protein of unknown function DUF652  31.93 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00355595  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  24.81 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0729  SSU processome protein Utp24  38.79 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.857115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0691  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>