18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1118 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1118  Protein of unknown function DUF652  100 
 
 		 118 aa  234  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00355595  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2208  rpo operon protein  35.54 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.968632  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2241  nucleotide binding protein, PINc  31.93 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2862  nucleotide binding protein, PINc  34.21 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00180077  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0604  nucleotide binding protein, PINc  34.75 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  30.51 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2397  PilT N-term./Vapc superfamily-like protein  34.71 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  31.36 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2279  hypothetical protein  26.5 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000036024  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  31.97 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0653  nucleotide binding protein PINc  28.21 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198585  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0246  nucleotide binding protein, PINc  35.19 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1614  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0923  PilT domain-containing protein  29.17 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.223217 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  31.4 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  33.88 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0729  SSU processome protein Utp24  32.56 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.857115 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0896  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.996154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>