18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0587 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0587  nucleotide binding protein PINc  100 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.579248  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0236  SSU processome protein Utp24  91.6 
 
 		 131 aa  229  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0516612  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1331  hypothetical protein  90.84 
 
 		 131 aa  225  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0653  nucleotide binding protein PINc  67.69 
 
 		 131 aa  189  8e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198585  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  51.54 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60429  predicted protein  29.84 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0007968  normal  0.2488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2862  nucleotide binding protein, PINc  29.27 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00180077  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2397  PilT N-term./Vapc superfamily-like protein  27.37 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15766  predicted protein  29.84 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.841856 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  23.77 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03760  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10865  DUF652 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03340)  28.57 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  29.92 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  24.17 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  26.61 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27263  predicted protein  24.6 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0604  nucleotide binding protein, PINc  24.19 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0691  PilT domain-containing protein  24.43 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>