13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1989 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1989  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 113 aa  224  4e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0923  PilT domain-containing protein  64.29 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.223217 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1614  PilT domain-containing protein  62.5 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0896  PilT domain-containing protein  69.64 
 
 		 113 aa  134  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.996154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  31.48 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0691  PilT domain-containing protein  34.45 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0258  nucleotide binding protein, PINc  34.78 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000462302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  34.75 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2279  hypothetical protein  30.43 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000036024  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  35.4 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  34.82 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  27.19 
 
 		 366 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  28.07 
 
 		 359 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>