105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2497 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2497  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 78 aa  163  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2468  hypothetical protein  59.7 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0737911 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0104  hypothetical protein  53.62 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0924  regulatory protein, FmdB family  43.04 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  39.24 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  38.81 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  38.57 
 
 		 71 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  38.96 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  40.58 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  42.65 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  41.94 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  42.86 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  35.9 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  38.1 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  33.77 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  35.06 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  43.1 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  48.21 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  37.1 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  36.76 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  37.93 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  37.93 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  37.93 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  33.82 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  38.46 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  35.62 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  39.29 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  36.21 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  41.07 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  41.51 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  37.93 
 
 		 86 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  37.74 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  37.66 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  39.68 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  40.68 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  39.68 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  39.68 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  44.64 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  42.62 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  34.48 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  36.21 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  32.47 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  32.76 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  40.68 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  37.35 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  39.68 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  37.18 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  37.18 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  32.47 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  36.21 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  35.71 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  36.21 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  35.29 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  39.29 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  35.71 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  39.29 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  39.66 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  35.21 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  36.11 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  36.84 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  33.96 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  41.79 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  38.24 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  36.49 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  34.85 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  34.85 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  31.58 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  34.92 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  31.58 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  31.58 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  31.58 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  36.51 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  36.51 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  34.85 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  35 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  31.58 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  31.58 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  33.8 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  35.44 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  34.18 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  33.96 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  36.36 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  35.85 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  31.51 
 
 		 114 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  33.96 
 
 		 96 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  30.14 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  31.08 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  31.08 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  36.84 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  36.84 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  32.39 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>