More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0496 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0496  zinc-binding dehydrogenase  100 
 
 
345 aa  690    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.73 
 
 
344 aa  322  5e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000105685  hitchhiker  0.00137453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4130  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.31 
 
 
343 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  35.51 
 
 
352 aa  210  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2512  alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
346 aa  200  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.881464  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
401 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.14 
 
 
492 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.56 
 
 
351 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  39.56 
 
 
351 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
417 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  39.56 
 
 
299 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.14 
 
 
425 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
344 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  31.84 
 
 
401 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.76 
 
 
346 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.81 
 
 
347 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.94 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
343 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 
422 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.64 
 
 
401 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
401 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
401 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.41 
 
 
382 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.89 
 
 
347 aa  185  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.23 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.19 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.19 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.6 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.35 
 
 
401 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.19 
 
 
410 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.62 
 
 
389 aa  182  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  31.79 
 
 
346 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
402 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.24 
 
 
346 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
346 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  28.99 
 
 
346 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
415 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.71 
 
 
389 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.3 
 
 
410 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  30.71 
 
 
444 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.08 
 
 
405 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.99 
 
 
346 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
370 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
346 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.47 
 
 
387 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  31.79 
 
 
346 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
351 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.7 
 
 
379 aa  176  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 
347 aa  176  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.23 
 
 
388 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.08 
 
 
349 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.66 
 
 
346 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.66 
 
 
346 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.66 
 
 
346 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.66 
 
 
346 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.66 
 
 
346 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.66 
 
 
346 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  30.75 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.56 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.19 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.74 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  32.56 
 
 
395 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3155  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.26 
 
 
377 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633298  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0372  alcohol dehydrogenase  32 
 
 
348 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.95 
 
 
392 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.32 
 
 
384 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.49 
 
 
351 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  30.26 
 
 
377 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.01 
 
 
385 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.27 
 
 
415 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2881  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  30.26 
 
 
377 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.25 
 
 
390 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.59 
 
 
346 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  31.79 
 
 
389 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
389 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1755  alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 
403 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.44 
 
 
392 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
390 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
390 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.01 
 
 
376 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.92 
 
 
345 aa  169  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  30.92 
 
 
345 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.32 
 
 
351 aa  169  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
360 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00860  alcohol dehydrogenase, putative  37.89 
 
 
298 aa  168  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 
385 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11924  dehydrogenase  37.38 
 
 
384 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.1 
 
 
350 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.74 
 
 
377 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30 
 
 
377 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.23 
 
 
389 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.72 
 
 
396 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
433 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.97 
 
 
389 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  31.62 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.28 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>