50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3258 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3258  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  100 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2134  Formiminotransferase-cyclodeaminase  60.4 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1798  formiminotransferase-cyclodeaminase  60.4 
 
 		 208 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1750  Formiminotransferase-cyclodeaminase  61.08 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7115  Formiminotransferase-cyclodeaminase  57.43 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6555  formiminotransferase-cyclodeaminase  57.92 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911075  normal  0.092837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0507  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  56.52 
 
 		 207 aa  184  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3667  formiminotransferase-cyclodeaminase  58.42 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.245003  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  38.35 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.38 
 
 		 211 aa  151  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  46.59 
 
 		 518 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  36.36 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  39.22 
 
 		 555 aa  148  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0556  Formiminotransferase-cyclodeaminase  45.81 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4470  formiminotransferase-cyclodeaminase  43.94 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.74 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0325  hypothetical protein  42.94 
 
 		 209 aa  131  9e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0059  Formiminotransferase-cyclodeaminase  42.42 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.279753 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  35.75 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.38 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  38.35 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  34.3 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  39.78 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2862  Formiminotransferase-cyclodeaminase  43.48 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.93 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1023  formiminotransferase-cyclodeaminase  45 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.866401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  29.47 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00200  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  35.86 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.322798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5039  Formiminotransferase-cyclodeaminase  43 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402741  normal  0.343304 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20940  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  39.3 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0122  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.32 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  34 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24900  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  42.56 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.910504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0622  Formiminotransferase-cyclodeaminase  32.32 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.402773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  31.09 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1232  formiminotransferase-cyclodeaminase  32.95 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1223  formiminotransferase-cyclodeaminase  32.95 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  32.93 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1837  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  32.93 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0022592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4182  formiminotransferase-cyclodeaminase  50.3 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.311469  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0347  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  44.44 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  36.05 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2878  Formiminotransferase-cyclodeaminase  38.42 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0321  Formiminotransferase-cyclodeaminase  27.87 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3464  Formiminotransferase-cyclodeaminase  42.77 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2329  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  26.59 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2518  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  35.36 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1567  formiminotransferase-cyclodeaminase  35.36 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0279558  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0398  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  20.9 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>