51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1277 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  100 
 
 
210 aa  422  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  46.6 
 
 
211 aa  193  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  42.44 
 
 
210 aa  187  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  42.31 
 
 
555 aa  158  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  43.56 
 
 
518 aa  157  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.07 
 
 
212 aa  155  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  45.83 
 
 
210 aa  149  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  34.74 
 
 
212 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  41.03 
 
 
209 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  36.99 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4470  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.94 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0325  hypothetical protein  42.13 
 
 
209 aa  139  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  35.89 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.25 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  44.32 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1798  formiminotransferase-cyclodeaminase  41.58 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  39.32 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0059  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37.68 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.279753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2134  Formiminotransferase-cyclodeaminase  41.09 
 
 
208 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1750  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.59 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0507  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  43.98 
 
 
207 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7115  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.6 
 
 
207 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  28.64 
 
 
214 aa  122  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0556  Formiminotransferase-cyclodeaminase  33.5 
 
 
212 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6555  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.61 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911075  normal  0.092837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0122  formiminotransferase-cyclodeaminase  41.49 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3258  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  38.35 
 
 
210 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3667  formiminotransferase-cyclodeaminase  41.62 
 
 
213 aa  104  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.245003  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2862  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.54 
 
 
203 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  34.95 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5039  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37.75 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402741  normal  0.343304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  37.37 
 
 
495 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1023  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.87 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.866401  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00200  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  33.15 
 
 
210 aa  89  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.322798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  29.82 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1837  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  32.26 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0022592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20940  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  35.14 
 
 
209 aa  84.7  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0622  Formiminotransferase-cyclodeaminase  28.08 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.402773  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1232  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.43 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1223  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.43 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3464  Formiminotransferase-cyclodeaminase  32.35 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24900  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  32.47 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.910504  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0398  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  26.88 
 
 
193 aa  61.6  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2329  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  20.69 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4182  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.61 
 
 
268 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.311469  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0321  Formiminotransferase-cyclodeaminase  28.14 
 
 
179 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0347  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  33.98 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2878  Formiminotransferase-cyclodeaminase  33.65 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1726  hypothetical protein  22.73 
 
 
170 aa  52.8  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11880  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  29.51 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.626287  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1240  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  26.5 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.882134  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>