49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2123 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  100 
 
 
211 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1837  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  99.05 
 
 
211 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0022592  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.1 
 
 
212 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  36.18 
 
 
213 aa  138  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  33.33 
 
 
212 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.46 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  34.85 
 
 
518 aa  128  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  39.81 
 
 
207 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  34.65 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  34.36 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  39.8 
 
 
555 aa  116  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  32.32 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4470  formiminotransferase-cyclodeaminase  34.43 
 
 
210 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0325  hypothetical protein  31.82 
 
 
209 aa  107  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.38 
 
 
205 aa  106  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  30.85 
 
 
210 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0507  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  39.89 
 
 
207 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  30.1 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0556  Formiminotransferase-cyclodeaminase  34.43 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2862  Formiminotransferase-cyclodeaminase  33.33 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1798  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.5 
 
 
208 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2134  Formiminotransferase-cyclodeaminase  38.5 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3258  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  35.57 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1750  Formiminotransferase-cyclodeaminase  38 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  30.64 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6555  formiminotransferase-cyclodeaminase  36.68 
 
 
208 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911075  normal  0.092837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7115  Formiminotransferase-cyclodeaminase  36.68 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5039  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37.78 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402741  normal  0.343304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0059  Formiminotransferase-cyclodeaminase  27.66 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.279753 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  35.59 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  27.04 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3667  formiminotransferase-cyclodeaminase  33.33 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.245003  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0122  formiminotransferase-cyclodeaminase  30.06 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  27.67 
 
 
495 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20940  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  30.94 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0347  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  32.97 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0321  Formiminotransferase-cyclodeaminase  26.52 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4182  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.96 
 
 
268 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.311469  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00200  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  24.86 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.322798 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0398  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  25.7 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2878  Formiminotransferase-cyclodeaminase  33.15 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0622  Formiminotransferase-cyclodeaminase  22.35 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.402773  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1023  formiminotransferase-cyclodeaminase  31.32 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.866401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24900  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  32.6 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.910504  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3464  Formiminotransferase-cyclodeaminase  34.62 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1232  formiminotransferase-cyclodeaminase  30.86 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1223  formiminotransferase-cyclodeaminase  30.86 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11880  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  24.6 
 
 
158 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.626287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2329  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  24 
 
 
197 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>