51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0507 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0507  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  100 
 
 
207 aa  411  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2134  Formiminotransferase-cyclodeaminase  58.45 
 
 
208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1750  Formiminotransferase-cyclodeaminase  58.45 
 
 
220 aa  208  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1798  formiminotransferase-cyclodeaminase  57.97 
 
 
208 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7115  Formiminotransferase-cyclodeaminase  57 
 
 
207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6555  formiminotransferase-cyclodeaminase  55.07 
 
 
208 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911075  normal  0.092837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3258  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  56.52 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3667  formiminotransferase-cyclodeaminase  57.21 
 
 
213 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.245003  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4470  formiminotransferase-cyclodeaminase  49.71 
 
 
210 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  42.79 
 
 
518 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  41.67 
 
 
555 aa  156  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.31 
 
 
212 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0059  Formiminotransferase-cyclodeaminase  44.68 
 
 
212 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.279753 
 
 
-
 
NC_002950  PG0325  hypothetical protein  41.49 
 
 
209 aa  144  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  42.79 
 
 
212 aa  141  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37.85 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  44.25 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5039  Formiminotransferase-cyclodeaminase  47.83 
 
 
207 aa  134  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402741  normal  0.343304 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  43.98 
 
 
210 aa  134  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.07 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  35.29 
 
 
217 aa  132  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0556  Formiminotransferase-cyclodeaminase  41 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  35.61 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  39.13 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  41.15 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0122  formiminotransferase-cyclodeaminase  41.79 
 
 
212 aa  124  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.72 
 
 
205 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  36.95 
 
 
208 aa  115  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2862  Formiminotransferase-cyclodeaminase  44.13 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  30.34 
 
 
214 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0622  Formiminotransferase-cyclodeaminase  34 
 
 
217 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.402773  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1232  formiminotransferase-cyclodeaminase  35.84 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1223  formiminotransferase-cyclodeaminase  35.84 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1837  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  39.01 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0022592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  39.89 
 
 
211 aa  91.7  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20940  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  38.2 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00200  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  32.84 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.322798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24900  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  36.68 
 
 
207 aa  85.5  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.910504  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  28.57 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1023  formiminotransferase-cyclodeaminase  39.89 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.866401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4182  formiminotransferase-cyclodeaminase  46.97 
 
 
268 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.311469  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0347  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  41.38 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2518  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  43.81 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1567  formiminotransferase-cyclodeaminase  43.81 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0279558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2878  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.41 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3464  Formiminotransferase-cyclodeaminase  35.86 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0321  Formiminotransferase-cyclodeaminase  30.39 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2329  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  27.57 
 
 
197 aa  58.9  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  32.59 
 
 
495 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2130  formiminotransferase-like  31.51 
 
 
490 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11880  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  31.25 
 
 
158 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.626287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>