48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1837 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1837  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0022592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  99.05 
 
 		 211 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.61 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  36.18 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  33.33 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.29 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  38.51 
 
 		 518 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  34.65 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  34.36 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  39.8 
 
 		 555 aa  116  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  32.32 
 
 		 210 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_002950  PG0325  hypothetical protein  32.32 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4470  formiminotransferase-cyclodeaminase  34.43 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.38 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  30.3 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0507  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  39.01 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  30.1 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0556  Formiminotransferase-cyclodeaminase  34.43 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2862  Formiminotransferase-cyclodeaminase  33.33 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1798  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.5 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2134  Formiminotransferase-cyclodeaminase  38.5 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1750  Formiminotransferase-cyclodeaminase  38 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3258  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  35.57 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  29.12 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6555  formiminotransferase-cyclodeaminase  36.68 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911075  normal  0.092837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7115  Formiminotransferase-cyclodeaminase  36.68 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0059  Formiminotransferase-cyclodeaminase  27.66 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.279753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5039  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37.78 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402741  normal  0.343304 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  26.87 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  35.03 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0122  formiminotransferase-cyclodeaminase  28.57 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3667  formiminotransferase-cyclodeaminase  33.79 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.245003  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  27.67 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20940  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  30.94 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0347  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  32.97 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0321  Formiminotransferase-cyclodeaminase  25.84 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00200  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  24.86 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.322798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4182  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.96 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.311469  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0622  Formiminotransferase-cyclodeaminase  22.35 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.402773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1023  formiminotransferase-cyclodeaminase  31.32 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.866401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2878  Formiminotransferase-cyclodeaminase  33.15 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24900  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  32.6 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.910504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3464  Formiminotransferase-cyclodeaminase  34.62 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1223  formiminotransferase-cyclodeaminase  30.73 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1232  formiminotransferase-cyclodeaminase  30.73 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2329  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  24 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11880  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  24.6 
 
 		 158 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.626287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>