52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3495 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  100 
 
 
211 aa  428  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  50.97 
 
 
210 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  46.6 
 
 
210 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  42.71 
 
 
518 aa  158  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  36.97 
 
 
212 aa  152  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.2 
 
 
209 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  39.05 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  40.7 
 
 
555 aa  140  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0556  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37.7 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4470  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.92 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0325  hypothetical protein  35.47 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  33.99 
 
 
212 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1798  formiminotransferase-cyclodeaminase  42.08 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2134  Formiminotransferase-cyclodeaminase  42.08 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3258  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  40.38 
 
 
210 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1750  Formiminotransferase-cyclodeaminase  42.08 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37.19 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7115  Formiminotransferase-cyclodeaminase  41.71 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712261  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  38.61 
 
 
210 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  36.1 
 
 
207 aa  121  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  36.06 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6555  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.1 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911075  normal  0.092837 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.63 
 
 
205 aa  116  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0507  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  44.25 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  28.57 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0059  Formiminotransferase-cyclodeaminase  34.3 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.279753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3667  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.1 
 
 
213 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.245003  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2862  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.06 
 
 
203 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1023  formiminotransferase-cyclodeaminase  39 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.866401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0122  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.37 
 
 
212 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5039  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.31 
 
 
207 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402741  normal  0.343304 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  35 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0622  Formiminotransferase-cyclodeaminase  29.69 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.402773  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00200  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  29.63 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.322798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20940  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  27.54 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1837  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  29.17 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0022592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  29.17 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  33.16 
 
 
495 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3464  Formiminotransferase-cyclodeaminase  35.61 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4182  formiminotransferase-cyclodeaminase  36.36 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.311469  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0398  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  28.14 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0321  Formiminotransferase-cyclodeaminase  30.64 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24900  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  32.34 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.910504  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1223  formiminotransferase-cyclodeaminase  28.81 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1232  formiminotransferase-cyclodeaminase  28.81 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2130  formiminotransferase-like  29.53 
 
 
490 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0347  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  32.97 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2878  Formiminotransferase-cyclodeaminase  33.14 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2329  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  22.04 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2518  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  32.26 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1567  formiminotransferase-cyclodeaminase  32.26 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0279558  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11880  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  28.46 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.626287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>