19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0398 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0398  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  100 
 
 
193 aa  384  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  29.65 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  28.14 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  25.85 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  27.18 
 
 
217 aa  61.6  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  26.85 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  23.98 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  24.15 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  24.4 
 
 
212 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  25.82 
 
 
213 aa  53.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  24.46 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  23.81 
 
 
518 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  23.08 
 
 
495 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  24.76 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  25.93 
 
 
555 aa  45.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  26.26 
 
 
208 aa  45.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  27.34 
 
 
211 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  25.89 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  27.62 
 
 
210 aa  42  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>