52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4575 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  100 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0122  formiminotransferase-cyclodeaminase  95.28 
 
 		 212 aa  324  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0059  Formiminotransferase-cyclodeaminase  62.26 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.279753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4470  formiminotransferase-cyclodeaminase  54.81 
 
 		 210 aa  221  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.58 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  38.83 
 
 		 518 aa  141  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0325  hypothetical protein  42.13 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  36.06 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7115  Formiminotransferase-cyclodeaminase  44.06 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  39.32 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0507  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  42.79 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6555  formiminotransferase-cyclodeaminase  42.08 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911075  normal  0.092837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  29.47 
 
 		 210 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0556  Formiminotransferase-cyclodeaminase  35.29 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1750  Formiminotransferase-cyclodeaminase  42.39 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  32.38 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  31.53 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  33.33 
 
 		 555 aa  122  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2134  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.76 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1798  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.76 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  30.56 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.5 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  30.77 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  37.25 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  33.17 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3258  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  39.78 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2862  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.21 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5039  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37.89 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402741  normal  0.343304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3667  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.57 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.245003  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  30.85 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1023  formiminotransferase-cyclodeaminase  41.28 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.866401  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  33.72 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1232  formiminotransferase-cyclodeaminase  32.76 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1223  formiminotransferase-cyclodeaminase  32.76 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1837  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  26.97 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0022592  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2329  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  27.75 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24900  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  32.81 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.910504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0622  Formiminotransferase-cyclodeaminase  28.89 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.402773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  28.67 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20940  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  31.25 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00200  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  28.65 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.322798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4182  formiminotransferase-cyclodeaminase  42.71 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.311469  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0321  Formiminotransferase-cyclodeaminase  31.14 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  39.13 
 
 		 495 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0347  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  40.8 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3464  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.64 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2878  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.24 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0398  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  24.4 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2518  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  37.85 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1567  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.85 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0279558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2130  formiminotransferase-like  28.97 
 
 		 490 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1726  hypothetical protein  27.22 
 
 		 170 aa  41.6  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>