49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4182 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4182  formiminotransferase-cyclodeaminase  100 
 
 		 268 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.311469  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5039  Formiminotransferase-cyclodeaminase  60.87 
 
 		 207 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402741  normal  0.343304 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  45.4 
 
 		 518 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0059  Formiminotransferase-cyclodeaminase  44.17 
 
 		 212 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.279753 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  37.63 
 
 		 555 aa  135  9e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  43.03 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37.95 
 
 		 212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1798  formiminotransferase-cyclodeaminase  47.62 
 
 		 208 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6555  formiminotransferase-cyclodeaminase  49.48 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911075  normal  0.092837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1750  Formiminotransferase-cyclodeaminase  46.5 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2134  Formiminotransferase-cyclodeaminase  47.34 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  34.76 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4470  formiminotransferase-cyclodeaminase  43.72 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7115  Formiminotransferase-cyclodeaminase  45.37 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712261  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0325  hypothetical protein  40 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37.91 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  33.15 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3258  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  47.09 
 
 		 210 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0507  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  46.29 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  42.05 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  37.77 
 
 		 213 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0347  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  53.67 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0556  Formiminotransferase-cyclodeaminase  35.33 
 
 		 212 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3667  formiminotransferase-cyclodeaminase  48.82 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.245003  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3464  Formiminotransferase-cyclodeaminase  48.9 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  38.65 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.46 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  39.89 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2878  Formiminotransferase-cyclodeaminase  47.78 
 
 		 206 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  32.99 
 
 		 207 aa  98.6  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  37.77 
 
 		 211 aa  95.5  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0622  Formiminotransferase-cyclodeaminase  34.76 
 
 		 217 aa  93.6  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.402773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2862  Formiminotransferase-cyclodeaminase  44.2 
 
 		 203 aa  93.2  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1837  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  37.77 
 
 		 211 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0022592  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  26.9 
 
 		 214 aa  92  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0122  formiminotransferase-cyclodeaminase  42.02 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  35 
 
 		 208 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1023  formiminotransferase-cyclodeaminase  43.27 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.866401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  36.72 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00200  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  31.82 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.322798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20940  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  36.02 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24900  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  36.04 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.910504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11880  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  38.28 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.626287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1223  formiminotransferase-cyclodeaminase  30.06 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1232  formiminotransferase-cyclodeaminase  30.06 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  29.68 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2329  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  24.62 
 
 		 197 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0321  Formiminotransferase-cyclodeaminase  26.79 
 
 		 179 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2130  formiminotransferase-like  36.09 
 
 		 490 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>