49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0325 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0325  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  44.27 
 
 
217 aa  157  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  47.62 
 
 
212 aa  157  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  39.7 
 
 
555 aa  155  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  40.39 
 
 
518 aa  151  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4470  formiminotransferase-cyclodeaminase  41.11 
 
 
210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  40 
 
 
213 aa  141  8e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  35.47 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  41.29 
 
 
205 aa  132  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  42.13 
 
 
210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.2 
 
 
210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  38.19 
 
 
210 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  39.15 
 
 
207 aa  126  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0507  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  41.49 
 
 
207 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  42.13 
 
 
212 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  36.08 
 
 
212 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2134  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.64 
 
 
208 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1750  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.2 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1798  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.64 
 
 
208 aa  118  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3258  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  42.94 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0059  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.279753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7115  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.44 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  33.16 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6555  formiminotransferase-cyclodeaminase  40.22 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911075  normal  0.092837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0556  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37.21 
 
 
212 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3667  formiminotransferase-cyclodeaminase  39.01 
 
 
213 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.245003  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0122  formiminotransferase-cyclodeaminase  42.13 
 
 
212 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5039  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.72 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402741  normal  0.343304 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2862  Formiminotransferase-cyclodeaminase  34.01 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0622  Formiminotransferase-cyclodeaminase  29.79 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.402773  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1837  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  33.33 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0022592  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.55 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  32.74 
 
 
211 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00200  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  30.48 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.322798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20940  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  34.3 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  27.8 
 
 
209 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1223  formiminotransferase-cyclodeaminase  36.31 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1232  formiminotransferase-cyclodeaminase  36.31 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1023  formiminotransferase-cyclodeaminase  33.86 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.866401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24900  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  32.68 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.910504  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  37.41 
 
 
495 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4182  formiminotransferase-cyclodeaminase  41.18 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.311469  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0321  Formiminotransferase-cyclodeaminase  32.48 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3464  Formiminotransferase-cyclodeaminase  36.09 
 
 
223 aa  62  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0347  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  37.14 
 
 
206 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2130  formiminotransferase-like  30.92 
 
 
490 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2878  Formiminotransferase-cyclodeaminase  36.09 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2329  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  25.39 
 
 
197 aa  51.6  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11880  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  30.33 
 
 
158 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.626287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>