42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8712 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8712  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5550  putative PAS/PAC sensor protein  57.58 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2133  putative PAS/PAC sensor protein  60.27 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0282  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.283126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0362  putative PAS/PAC sensor protein  44.19 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2168  putative PAS/PAC sensor protein  42.35 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.242596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1710  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.010044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1781  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345246  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1366  putative PAS/PAC sensor protein  38.98 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1206  PAS sensor protein  38.98 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2761  putative PAS/PAC sensor protein  32.8 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4841  putative PAS/PAC sensor protein  37.29 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1145  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2802  putative PAS/PAC sensor protein  36.96 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.540476  normal  0.477024 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0639  putative PAS/PAC sensor protein  33.04 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0298  putative PAS/PAC sensor protein  38.55 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.169835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6742  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.63921  normal  0.585827 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3616  putative PAS/PAC sensor protein  33.6 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4662  PAS  33.6 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5581  putative PAS/PAC sensor protein  34.75 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.595222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2658  putative PAS/PAC sensor protein  37.65 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3857  putative PAS/PAC sensor protein  36.47 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.759378  normal  0.914632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3172  putative PAS/PAC sensor protein  38.55 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.920236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3152  sensory box protein  42.86 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4485  putative PAS/PAC sensor protein  31.2 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2500  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0488  putative PAS/PAC sensor protein  36.96 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0214  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4051  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1202  putative PAS/PAC sensor protein  34.94 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1034  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 1183 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0431  putative PAS/PAC sensor protein  51.11 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00281975  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0993  putative PAS/PAC sensor protein  35.37 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  46.67 
 
 		 1589 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0466  putative PAS/PAC sensor protein  32.18 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.98341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0483  putative PAS/PAC sensor protein  32.18 
 
 		 147 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000401014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  51.11 
 
 		 1969 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 851 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  27.08 
 
 		 1154 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3701  putative PAS/PAC sensor protein  28.92 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.5 
 
 		 1248 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>