61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6619 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6619  acyltransferase 3  100 
 
 
345 aa  680    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6620  acyltransferase 3  42.6 
 
 
350 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580615  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0892  acyltransferase family protein  27.68 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000392602  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  32.75 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  32.75 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  25.94 
 
 
397 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  24.19 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  28.71 
 
 
695 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  28.1 
 
 
354 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  26.46 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  32 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  29.67 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  28.38 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  28.82 
 
 
629 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  25.24 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  24.06 
 
 
640 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  28.07 
 
 
667 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  28.97 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  30.14 
 
 
393 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  28.96 
 
 
629 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  28.96 
 
 
647 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  27.78 
 
 
684 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  27.36 
 
 
327 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  27.65 
 
 
679 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  26.38 
 
 
658 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  26.18 
 
 
673 aa  46.2  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  27.94 
 
 
651 aa  46.6  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  28.24 
 
 
710 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.68 
 
 
639 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  34.31 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  25.61 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  28.24 
 
 
710 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  26.42 
 
 
662 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  27.76 
 
 
386 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  26.45 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  23.91 
 
 
658 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  23.91 
 
 
658 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.49 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.77 
 
 
656 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2458  putative acyltransferase  35.14 
 
 
424 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  31.4 
 
 
376 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  30.6 
 
 
690 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  30.89 
 
 
378 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4599  acyltransferase 3  30.48 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  25.34 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  28.86 
 
 
716 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  26.23 
 
 
662 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  31.9 
 
 
380 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  25.15 
 
 
362 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  26.3 
 
 
387 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  26.3 
 
 
387 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  27.46 
 
 
362 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  31.36 
 
 
660 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  23.94 
 
 
658 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  28.03 
 
 
660 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  25.27 
 
 
354 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.79 
 
 
616 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  26.92 
 
 
598 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  34.4 
 
 
418 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  27.27 
 
 
691 aa  42.7  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  26.28 
 
 
399 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>