40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0281 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0281  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
180 aa  360  6e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1633  beta-lactamase domain-containing protein  90.56 
 
 
180 aa  307  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.101442  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0995  beta-lactamase domain-containing protein  88.27 
 
 
162 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1483  beta-lactamase domain-containing protein  59.44 
 
 
182 aa  224  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.550201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0375  beta-lactamase domain-containing protein  45.81 
 
 
176 aa  155  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.397371  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1673  beta-lactamase domain-containing protein  49.72 
 
 
174 aa  155  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.779907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1537  beta-lactamase domain-containing protein  45.81 
 
 
176 aa  154  6e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299515  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0442  beta-lactamase domain-containing protein  45.93 
 
 
174 aa  148  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000184233  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1091  beta-lactamase domain-containing protein  44.13 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.801328  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0941  beta-lactamase domain-containing protein  36.24 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
259 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
259 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  28.21 
 
 
259 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  26.62 
 
 
257 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
313 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 
250 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1727  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 
235 aa  45.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  26.87 
 
 
317 aa  45.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 
257 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 
226 aa  45.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  21.31 
 
 
237 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 
233 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  36.67 
 
 
271 aa  43.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  25.74 
 
 
290 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
248 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0068  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.78 
 
 
265 aa  42  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0383  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 
213 aa  42  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 
318 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.58 
 
 
361 aa  42  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0721  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.73 
 
 
269 aa  42  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03883  hypothetical protein  40.91 
 
 
216 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  24.06 
 
 
209 aa  41.6  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  23.27 
 
 
250 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  24.43 
 
 
308 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  21.08 
 
 
273 aa  41.2  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  23.38 
 
 
331 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  27.42 
 
 
238 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>