44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0995 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0995  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
162 aa  320  6e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1633  beta-lactamase domain-containing protein  89.51 
 
 
180 aa  274  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.101442  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0281  beta-lactamase domain-containing protein  88.27 
 
 
180 aa  270  8.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1483  beta-lactamase domain-containing protein  58.02 
 
 
182 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.550201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0375  beta-lactamase domain-containing protein  48.72 
 
 
176 aa  153  9e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.397371  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1673  beta-lactamase domain-containing protein  53.21 
 
 
174 aa  152  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.779907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1537  beta-lactamase domain-containing protein  48.72 
 
 
176 aa  150  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299515  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1091  beta-lactamase domain-containing protein  47.44 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.801328  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0442  beta-lactamase domain-containing protein  48.99 
 
 
174 aa  142  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000184233  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0941  beta-lactamase domain-containing protein  34.9 
 
 
185 aa  89.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 
250 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 
235 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 
233 aa  47.8  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  25.74 
 
 
250 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  23.94 
 
 
209 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  21.08 
 
 
237 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  25.25 
 
 
250 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 
213 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 
248 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  21.28 
 
 
266 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  32.04 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
259 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 
313 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
259 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  29.03 
 
 
238 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  25 
 
 
259 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  25.37 
 
 
317 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  22.41 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  24.52 
 
 
257 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  24.75 
 
 
250 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1747  hypothetical protein  35 
 
 
271 aa  42.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  25.69 
 
 
337 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  33.78 
 
 
226 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 
257 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 
208 aa  41.2  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1727  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 
219 aa  41.2  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0068  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.78 
 
 
265 aa  41.2  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03883  hypothetical protein  38.64 
 
 
216 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  21.77 
 
 
331 aa  41.2  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  23.27 
 
 
244 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  24.53 
 
 
244 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0023  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
268 aa  40.4  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
396 aa  40.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>