32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3149 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  100 
 
 
808 aa  1650    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3066  hypothetical protein  32.59 
 
 
815 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.690569 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1209  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  31.3 
 
 
872 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00285294 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0175  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  31.38 
 
 
812 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0249  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  31.47 
 
 
863 aa  357  6.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2859  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  30.34 
 
 
854 aa  335  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000287651  normal  0.328764 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2235  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  29.12 
 
 
881 aa  332  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0785  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  30.46 
 
 
884 aa  330  6e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.826413  normal  0.126691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2270  hypothetical protein  28.54 
 
 
840 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807987  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0662  hypothetical protein  26.91 
 
 
868 aa  290  7e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  26.77 
 
 
891 aa  231  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  25.66 
 
 
824 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  26.53 
 
 
840 aa  208  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  25.54 
 
 
837 aa  195  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3138  hypothetical protein  23.54 
 
 
768 aa  195  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000469073  hitchhiker  0.00590217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  25.4 
 
 
836 aa  167  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0927  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.37 
 
 
961 aa  166  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419112  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1548  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  26.07 
 
 
704 aa  162  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.17 
 
 
1030 aa  161  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2957  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.09 
 
 
998 aa  154  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.27 
 
 
1045 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1062  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  26.73 
 
 
1048 aa  140  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  24.71 
 
 
736 aa  126  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0967  uncharacterized membrane protein required for N-linked glycosylation-like protein  55.26 
 
 
83 aa  99.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.152221 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.89 
 
 
2073 aa  65.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0075  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  20.94 
 
 
712 aa  52.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.70229 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55198  STT3 subunit-like protein  21.55 
 
 
894 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835655  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1479  hypothetical protein  33.33 
 
 
774 aa  48.1  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.202348  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01455  hypothetical protein similar to oligosaccharyl transferase (Eurofung)  22 
 
 
741 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.531962 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82607  oligosaccharyl transferase subunit  23.48 
 
 
745 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.214118  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55197  oligosaccharyl transferase  22.24 
 
 
911 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1805  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  21.66 
 
 
738 aa  45.8  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>