28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2235 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0785  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  46.32 
 
 		 884 aa  806    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.826413  normal  0.126691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1209  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  44.41 
 
 		 872 aa  721    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00285294 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0249  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  48.24 
 
 		 863 aa  819    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2859  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  41.45 
 
 		 854 aa  677    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000287651  normal  0.328764 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2235  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  100 
 
 		 881 aa  1786    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0662  hypothetical protein  43.81 
 
 		 868 aa  679    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0175  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  41.67 
 
 		 812 aa  566  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3066  hypothetical protein  35.12 
 
 		 815 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.690569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2270  hypothetical protein  29.67 
 
 		 840 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  28.88 
 
 		 808 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  30.61 
 
 		 840 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  31.66 
 
 		 837 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  27.78 
 
 		 891 aa  300  8e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  30.28 
 
 		 824 aa  295  3e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  27.51 
 
 		 836 aa  238  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0927  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  26.61 
 
 		 961 aa  214  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419112  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.6 
 
 		 1045 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  31.28 
 
 		 1030 aa  158  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1062  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  28.18 
 
 		 1048 aa  152  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1548  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  24.85 
 
 		 704 aa  129  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3138  hypothetical protein  21.65 
 
 		 768 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000469073  hitchhiker  0.00590217 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2957  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.41 
 
 		 998 aa  114  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0967  uncharacterized membrane protein required for N-linked glycosylation-like protein  63.86 
 
 		 83 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.152221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  32.35 
 
 		 736 aa  87.8  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1479  hypothetical protein  33.77 
 
 		 774 aa  55.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.202348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2819  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  32.09 
 
 		 754 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.36 
 
 		 2073 aa  49.3  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01455  hypothetical protein similar to oligosaccharyl transferase (Eurofung)  20.87 
 
 		 741 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.531962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>