26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0662 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0249  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  42.79 
 
 
863 aa  671    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2235  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  43.47 
 
 
881 aa  658    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0662  hypothetical protein  100 
 
 
868 aa  1759    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0785  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  39.37 
 
 
884 aa  632  1e-180  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.826413  normal  0.126691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1209  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  41.02 
 
 
872 aa  601  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00285294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2859  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  38.54 
 
 
854 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000287651  normal  0.328764 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0175  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  38.24 
 
 
812 aa  485  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3066  hypothetical protein  32.08 
 
 
815 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.690569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  30.41 
 
 
840 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2270  hypothetical protein  29.19 
 
 
840 aa  348  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807987  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  30.93 
 
 
837 aa  344  5e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  28.71 
 
 
891 aa  317  8e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  28.94 
 
 
824 aa  287  5e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  27.24 
 
 
808 aa  283  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0927  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  26.96 
 
 
961 aa  218  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419112  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  27.75 
 
 
836 aa  210  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  26.14 
 
 
1045 aa  210  9e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.95 
 
 
1030 aa  179  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2957  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.67 
 
 
998 aa  169  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1062  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  26.28 
 
 
1048 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3138  hypothetical protein  24.14 
 
 
768 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000469073  hitchhiker  0.00590217 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1548  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  23.85 
 
 
704 aa  117  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0967  uncharacterized membrane protein required for N-linked glycosylation-like protein  61.45 
 
 
83 aa  106  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.152221 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.87 
 
 
2073 aa  106  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  35 
 
 
736 aa  70.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0438  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  23.19 
 
 
826 aa  44.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>