29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0249 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0785  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  50.79 
 
 
884 aa  892    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.826413  normal  0.126691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2859  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  44.12 
 
 
854 aa  706    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000287651  normal  0.328764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1209  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  53.66 
 
 
872 aa  923    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00285294 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0249  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  100 
 
 
863 aa  1778    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2235  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  47.46 
 
 
881 aa  773    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0662  hypothetical protein  42.79 
 
 
868 aa  656    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0175  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  39.98 
 
 
812 aa  534  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3066  hypothetical protein  34.21 
 
 
815 aa  488  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.690569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2270  hypothetical protein  30.5 
 
 
840 aa  389  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807987  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  28.95 
 
 
840 aa  334  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  29.41 
 
 
837 aa  331  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  30.7 
 
 
808 aa  332  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  28.96 
 
 
891 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  30.86 
 
 
824 aa  293  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.74 
 
 
1045 aa  211  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0927  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  26.87 
 
 
961 aa  208  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419112  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  26.38 
 
 
836 aa  207  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2957  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.03 
 
 
998 aa  194  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.16 
 
 
1030 aa  191  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1062  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  26.04 
 
 
1048 aa  173  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  25.87 
 
 
736 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0967  uncharacterized membrane protein required for N-linked glycosylation-like protein  75.9 
 
 
83 aa  135  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.152221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3138  hypothetical protein  21.05 
 
 
768 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000469073  hitchhiker  0.00590217 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1548  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  26.62 
 
 
704 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82607  oligosaccharyl transferase subunit  22.82 
 
 
745 aa  73.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.214118  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01455  hypothetical protein similar to oligosaccharyl transferase (Eurofung)  22.39 
 
 
741 aa  73.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.531962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.44 
 
 
2073 aa  69.7  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49512  predicted protein  20.77 
 
 
743 aa  56.6  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545641 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0075  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  20.66 
 
 
712 aa  53.9  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.70229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>