31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2957 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0927  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  51.87 
 
 
961 aa  936    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2957  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  100 
 
 
998 aa  2022    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  35.38 
 
 
1030 aa  526  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  35.13 
 
 
1045 aa  510  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1062  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  35.6 
 
 
1048 aa  489  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  30.24 
 
 
837 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  30.02 
 
 
840 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  29.19 
 
 
824 aa  333  8e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  28.38 
 
 
891 aa  293  9e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0785  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.97 
 
 
884 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.826413  normal  0.126691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0249  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  24.76 
 
 
863 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1209  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  26.12 
 
 
872 aa  209  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00285294 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0662  hypothetical protein  25.57 
 
 
868 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0175  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  27.36 
 
 
812 aa  183  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3066  hypothetical protein  23.61 
 
 
815 aa  171  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.690569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  24 
 
 
808 aa  157  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2270  hypothetical protein  21.87 
 
 
840 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807987  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  26.08 
 
 
836 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2859  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  29.31 
 
 
854 aa  127  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000287651  normal  0.328764 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2235  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  29.52 
 
 
881 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  23.46 
 
 
736 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1548  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  23.9 
 
 
704 aa  105  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.66 
 
 
2073 aa  77  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3138  hypothetical protein  30.99 
 
 
768 aa  60.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000469073  hitchhiker  0.00590217 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4544  hypothetical protein  73.17 
 
 
101 aa  53.5  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.957812  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0154  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  22.98 
 
 
853 aa  48.1  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2819  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  36.17 
 
 
754 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0075  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  23.74 
 
 
712 aa  46.2  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.70229 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.32 
 
 
853 aa  45.8  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.05 
 
 
851 aa  45.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.63 
 
 
851 aa  45.1  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>