26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1209 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0785  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  42.82 
 
 
884 aa  736    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.826413  normal  0.126691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1209  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  100 
 
 
872 aa  1785    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00285294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2859  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  40.85 
 
 
854 aa  649    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000287651  normal  0.328764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0249  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  53.71 
 
 
863 aa  939    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2235  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  44.41 
 
 
881 aa  696    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0662  hypothetical protein  41.31 
 
 
868 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0175  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  38.95 
 
 
812 aa  487  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3066  hypothetical protein  34.62 
 
 
815 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.690569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  31.35 
 
 
808 aa  350  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2270  hypothetical protein  27.3 
 
 
840 aa  343  7e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807987  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  29.04 
 
 
891 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  28.96 
 
 
840 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  29.3 
 
 
837 aa  316  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  29.37 
 
 
824 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  27.29 
 
 
836 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0927  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.24 
 
 
961 aa  190  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419112  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.13 
 
 
1045 aa  188  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.45 
 
 
1030 aa  177  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1062  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  27.29 
 
 
1048 aa  143  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3138  hypothetical protein  22.18 
 
 
768 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000469073  hitchhiker  0.00590217 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0967  uncharacterized membrane protein required for N-linked glycosylation-like protein  74.7 
 
 
83 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.152221 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2957  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  29.91 
 
 
998 aa  131  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  28.68 
 
 
736 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1548  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  24.54 
 
 
704 aa  107  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.02 
 
 
2073 aa  60.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01455  hypothetical protein similar to oligosaccharyl transferase (Eurofung)  20.87 
 
 
741 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.531962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>