29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1062 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1062  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  100 
 
 		 1048 aa  2112    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  37.09 
 
 		 1030 aa  616  1e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  36.4 
 
 		 1045 aa  587  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0927  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  35.76 
 
 		 961 aa  515  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2957  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  35.69 
 
 		 998 aa  514  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  28.6 
 
 		 891 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  27.7 
 
 		 840 aa  255  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  27.15 
 
 		 837 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0249  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  26.54 
 
 		 863 aa  190  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1209  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  24.16 
 
 		 872 aa  171  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00285294 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  22.6 
 
 		 836 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2235  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  28.97 
 
 		 881 aa  153  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3066  hypothetical protein  23.78 
 
 		 815 aa  152  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.690569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0785  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  26.24 
 
 		 884 aa  148  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.826413  normal  0.126691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0175  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  30.74 
 
 		 812 aa  140  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  26.33 
 
 		 808 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  27.05 
 
 		 824 aa  135  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0662  hypothetical protein  28.23 
 
 		 868 aa  126  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2270  hypothetical protein  22.56 
 
 		 840 aa  120  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2859  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  26.65 
 
 		 854 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000287651  normal  0.328764 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  27.56 
 
 		 736 aa  74.3  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1548  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  25.19 
 
 		 704 aa  73.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  24.38 
 
 		 2073 aa  63.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0090  hypothetical protein  23.63 
 
 		 820 aa  55.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82607  oligosaccharyl transferase subunit  31.3 
 
 		 745 aa  52.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.214118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2819  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  43.08 
 
 		 754 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  20.94 
 
 		 851 aa  52  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  19.97 
 
 		 853 aa  51.6  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1479  hypothetical protein  25.66 
 
 		 774 aa  50.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.202348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>