26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3035 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  100 
 
 
474 aa  961    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  68.2 
 
 
499 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  68.2 
 
 
499 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  68.2 
 
 
499 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  74.85 
 
 
197 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  74.85 
 
 
197 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  37.79 
 
 
461 aa  240  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  36.87 
 
 
474 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  37.07 
 
 
522 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  33.69 
 
 
466 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  36.12 
 
 
499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  36.09 
 
 
449 aa  210  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  34.53 
 
 
447 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  34.67 
 
 
450 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  37.29 
 
 
469 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  35.78 
 
 
476 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  35.91 
 
 
481 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  36.07 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  32.64 
 
 
521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  35.48 
 
 
476 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  34.38 
 
 
492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  34.43 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  34.12 
 
 
506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  33.58 
 
 
436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  25.37 
 
 
550 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5291  hypothetical protein  29 
 
 
568 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.872454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>