33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1563 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  100 
 
 		 449 aa  914    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  52.24 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  54.21 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  53.65 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  41.86 
 
 		 499 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  45.15 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  44.57 
 
 		 474 aa  332  6e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  43.18 
 
 		 469 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  40.26 
 
 		 466 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  44 
 
 		 478 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  36.71 
 
 		 522 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  34.97 
 
 		 506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  35.25 
 
 		 521 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  37.53 
 
 		 481 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  36.73 
 
 		 476 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  37.81 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  36.5 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  36.71 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  35.65 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  32.09 
 
 		 499 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  32.09 
 
 		 499 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  32.09 
 
 		 499 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  36.59 
 
 		 197 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  36.59 
 
 		 197 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1030  hypothetical protein  26.38 
 
 		 572 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  28.87 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6307  replication initiator protein  26.1 
 
 		 572 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5522  replication initiator protein  27.04 
 
 		 569 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0195674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5539  replication initiator protein  24.6 
 
 		 573 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5326  replication initiator protein  25.62 
 
 		 572 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0150  hypothetical protein  27.33 
 
 		 577 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0404  hypothetical protein  30.33 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0922  hypothetical protein  29.57 
 
 		 527 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>