24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5591 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  100 
 
 		 197 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  100 
 
 		 197 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  89.42 
 
 		 499 aa  339  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  89.42 
 
 		 499 aa  339  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  89.42 
 
 		 499 aa  339  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  74.85 
 
 		 474 aa  274  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  33.81 
 
 		 522 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  37.32 
 
 		 499 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  44.24 
 
 		 476 aa  121  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  35.35 
 
 		 474 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  35.75 
 
 		 466 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  37.7 
 
 		 521 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  41.52 
 
 		 469 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  37.43 
 
 		 461 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  38.98 
 
 		 506 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  42.5 
 
 		 476 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  42.07 
 
 		 492 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  38.41 
 
 		 449 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  36 
 
 		 450 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  36.57 
 
 		 447 aa  104  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  40.62 
 
 		 481 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  40.24 
 
 		 478 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  36.26 
 
 		 478 aa  99  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  34.29 
 
 		 436 aa  88.6  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>