24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1116 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  886    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  65.47 
 
 		 447 aa  569  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  62.3 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  53.65 
 
 		 449 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  45.63 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  46.44 
 
 		 474 aa  332  9e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  46.61 
 
 		 461 aa  329  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  45.15 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  44.37 
 
 		 466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  45.12 
 
 		 478 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  40.45 
 
 		 481 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  35.43 
 
 		 522 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  36.16 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  37.28 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  35.74 
 
 		 521 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  38.75 
 
 		 478 aa  216  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  37.5 
 
 		 476 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  37.16 
 
 		 492 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  30.24 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  30.24 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  30.24 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  33.58 
 
 		 474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  34.29 
 
 		 197 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  34.29 
 
 		 197 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>