25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2106 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  85.65 
 
 		 476 aa  746    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  83.16 
 
 		 481 aa  779    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  88.04 
 
 		 492 aa  765    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  100 
 
 		 478 aa  944    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  60.17 
 
 		 476 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  45.66 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  45.02 
 
 		 461 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  43.94 
 
 		 474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  42.58 
 
 		 499 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  44.85 
 
 		 506 aa  324  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  40.62 
 
 		 450 aa  276  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  39.51 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  39.46 
 
 		 521 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  39.28 
 
 		 478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  37.98 
 
 		 447 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  38.75 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  38.03 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  38.01 
 
 		 522 aa  219  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  34.2 
 
 		 474 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  32.78 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  32.78 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  32.78 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  37.8 
 
 		 197 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  37.8 
 
 		 197 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  24.86 
 
 		 550 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>