24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8662 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  73.48 
 
 
461 aa  699    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  952    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  65.71 
 
 
474 aa  595  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  47.78 
 
 
499 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  47.21 
 
 
469 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  46.4 
 
 
481 aa  352  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  47.51 
 
 
476 aa  351  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  47.6 
 
 
478 aa  348  8e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  46.64 
 
 
450 aa  346  5e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  46.41 
 
 
492 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  45.66 
 
 
478 aa  330  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  41.63 
 
 
476 aa  324  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  44.14 
 
 
447 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  44.37 
 
 
436 aa  320  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  41.6 
 
 
506 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  38.35 
 
 
521 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  40.26 
 
 
449 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  36.79 
 
 
522 aa  262  8e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  33.26 
 
 
474 aa  210  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  31.81 
 
 
499 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  31.81 
 
 
499 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  31.81 
 
 
499 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  35.23 
 
 
197 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  35.23 
 
 
197 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>