24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4126 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  85.29 
 
 		 476 aa  746    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  100 
 
 		 481 aa  942    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  87.55 
 
 		 492 aa  766    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  84.2 
 
 		 478 aa  767    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  61.85 
 
 		 476 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  46.35 
 
 		 466 aa  359  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  44.14 
 
 		 474 aa  333  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  43.67 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  45.47 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  41.34 
 
 		 499 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  38.86 
 
 		 469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  39.56 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  41.91 
 
 		 478 aa  269  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  38.19 
 
 		 521 aa  260  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  40 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  38.57 
 
 		 436 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  36.04 
 
 		 449 aa  213  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  36.96 
 
 		 522 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  35.91 
 
 		 474 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  34.04 
 
 		 499 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  34.04 
 
 		 499 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  34.04 
 
 		 499 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  38.12 
 
 		 197 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  38.12 
 
 		 197 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>