25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3178 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  69.46 
 
 		 474 aa  665    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  100 
 
 		 499 aa  1025    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  100 
 
 		 499 aa  1025    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  100 
 
 		 499 aa  1025    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  89.42 
 
 		 197 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  89.42 
 
 		 197 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  36.38 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  35.55 
 
 		 474 aa  231  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  35.92 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  32.99 
 
 		 466 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  35.32 
 
 		 499 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  36.89 
 
 		 469 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  34.12 
 
 		 450 aa  217  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  33.9 
 
 		 447 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  34.76 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  31.82 
 
 		 521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  33.97 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  34.51 
 
 		 481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  34.5 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  33.91 
 
 		 476 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  31.01 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  34.19 
 
 		 492 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  31.52 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  33.73 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1030  hypothetical protein  27 
 
 		 572 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>