24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0080 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  928    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  73.48 
 
 		 466 aa  699    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  68.16 
 
 		 474 aa  608  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  51.28 
 
 		 499 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  49.47 
 
 		 469 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  49.65 
 
 		 478 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  46.77 
 
 		 450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  45.27 
 
 		 476 aa  336  7e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  46.61 
 
 		 436 aa  329  8e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  43.45 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  44 
 
 		 492 aa  323  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  45.02 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  43.74 
 
 		 447 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  41.97 
 
 		 476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  45.15 
 
 		 449 aa  309  9e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  40.73 
 
 		 521 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  40.7 
 
 		 506 aa  295  9e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  40.25 
 
 		 522 aa  293  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  37.79 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  34.15 
 
 		 499 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  34.15 
 
 		 499 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  34.15 
 
 		 499 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  36.9 
 
 		 197 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  36.9 
 
 		 197 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>