24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7035 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1015    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  52.28 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  51.28 
 
 		 461 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  47.78 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  48.63 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  47.51 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  45.63 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  44.49 
 
 		 478 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  43.82 
 
 		 447 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  41.86 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  41.39 
 
 		 476 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  41.27 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  42.58 
 
 		 478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  41.31 
 
 		 492 aa  293  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  41.11 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  39.8 
 
 		 522 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  36.19 
 
 		 521 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  37.42 
 
 		 506 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  36.12 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  35.02 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  35.02 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  35.02 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  35.89 
 
 		 197 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  35.89 
 
 		 197 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>