24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4534 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  945    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  68.16 
 
 
461 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  65.71 
 
 
466 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  52.28 
 
 
499 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  50.74 
 
 
469 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  47.6 
 
 
478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  44.07 
 
 
450 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  46.44 
 
 
436 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  43.62 
 
 
481 aa  325  8.000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  42.82 
 
 
476 aa  324  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  44.19 
 
 
476 aa  323  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  44.9 
 
 
492 aa  322  9.000000000000001e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  43.24 
 
 
447 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  43.94 
 
 
478 aa  317  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  44.57 
 
 
449 aa  312  7.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  41.22 
 
 
522 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  41.55 
 
 
521 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  40 
 
 
506 aa  282  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  36.87 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  35.01 
 
 
499 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  35.01 
 
 
499 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  35.01 
 
 
499 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  34.85 
 
 
197 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  34.85 
 
 
197 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>