24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0635 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1051    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  41.22 
 
 		 474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  41.77 
 
 		 469 aa  302  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  40.66 
 
 		 461 aa  299  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  39.8 
 
 		 499 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  40.79 
 
 		 478 aa  276  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  38.04 
 
 		 466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  35.69 
 
 		 450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  35.43 
 
 		 436 aa  244  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  34.8 
 
 		 447 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  37 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  37.28 
 
 		 521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  35.56 
 
 		 474 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  36.83 
 
 		 476 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  37.07 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  37.84 
 
 		 476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  35.35 
 
 		 506 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  35.28 
 
 		 499 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  35.28 
 
 		 499 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  35.28 
 
 		 499 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  36.4 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  35.49 
 
 		 492 aa  200  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  33.81 
 
 		 197 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  33.81 
 
 		 197 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>