14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5291 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5291  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1148    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.872454  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0041  hypothetical protein  59.57 
 
 
552 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  55.44 
 
 
550 aa  609  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0150  hypothetical protein  56.34 
 
 
577 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8558  replication initiator protein  54.14 
 
 
543 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404857  hitchhiker  0.00106122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5326  replication initiator protein  53.94 
 
 
572 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6307  replication initiator protein  53.83 
 
 
572 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5522  replication initiator protein  54.95 
 
 
569 aa  538  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0195674  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1030  hypothetical protein  52.94 
 
 
572 aa  524  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5539  replication initiator protein  53.3 
 
 
573 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95807  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0922  hypothetical protein  48.18 
 
 
527 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6362  hypothetical protein  44.96 
 
 
555 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0404  hypothetical protein  53.77 
 
 
476 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2945  hypothetical protein  78.57 
 
 
56 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>