17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0150 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  73.44 
 
 
550 aa  822    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0150  hypothetical protein  100 
 
 
577 aa  1175    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5291  hypothetical protein  56.34 
 
 
568 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.872454  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0041  hypothetical protein  53.71 
 
 
552 aa  552  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8558  replication initiator protein  52.79 
 
 
543 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404857  hitchhiker  0.00106122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5326  replication initiator protein  51.53 
 
 
572 aa  498  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5522  replication initiator protein  51.4 
 
 
569 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0195674  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1030  hypothetical protein  52.44 
 
 
572 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6307  replication initiator protein  51.41 
 
 
572 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5539  replication initiator protein  52.29 
 
 
573 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95807  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0922  hypothetical protein  46.89 
 
 
527 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6362  hypothetical protein  46.59 
 
 
555 aa  445  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0404  hypothetical protein  49.89 
 
 
476 aa  405  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2945  hypothetical protein  50.85 
 
 
56 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  25.13 
 
 
450 aa  47.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  25.82 
 
 
449 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  26.16 
 
 
447 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>