47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1191 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  94.76 
 
 		 202 aa  344  8e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  79.41 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  59.52 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  58.18 
 
 		 173 aa  192  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  52.91 
 
 		 176 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  60.34 
 
 		 179 aa  181  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  53.61 
 
 		 175 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  60.36 
 
 		 170 aa  171  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  53.49 
 
 		 176 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  57.83 
 
 		 174 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  41.05 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  41.05 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  48.5 
 
 		 164 aa  142  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  44.05 
 
 		 166 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  47.9 
 
 		 172 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  44.05 
 
 		 166 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  45.56 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  45.45 
 
 		 163 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  45.45 
 
 		 163 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  43.3 
 
 		 187 aa  124  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  50 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  51.81 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  48.15 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  47.77 
 
 		 173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  43.71 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  42.77 
 
 		 163 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  39.52 
 
 		 163 aa  115  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  39.18 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  39.76 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  35.09 
 
 		 168 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  38.37 
 
 		 167 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  43.98 
 
 		 168 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  35.93 
 
 		 172 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  36.31 
 
 		 148 aa  101  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  39.63 
 
 		 166 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  48.91 
 
 		 91 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  41.82 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  37.7 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  39.18 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  36.31 
 
 		 163 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  37.28 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  75 
 
 		 56 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  28.99 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  31.48 
 
 		 160 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  26 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3602  membrane protein of unknown function UCP014873  25.97 
 
 		 174 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>