47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2887 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  327  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  73.81 
 
 		 179 aa  208  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  57.74 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  59.04 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  60.71 
 
 		 202 aa  186  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  60.71 
 
 		 232 aa  186  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  57.23 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  65.27 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  59.28 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  52.98 
 
 		 182 aa  167  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  55.88 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  53.29 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  46.71 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  46.71 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  42.26 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  42.26 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  49.1 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  44.91 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  45.56 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  48.15 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  46.79 
 
 		 193 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  43.53 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  48.41 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  39.77 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  39.77 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  40.49 
 
 		 301 aa  104  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  44.24 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  40.94 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  36.9 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  35.93 
 
 		 172 aa  97.4  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  44.97 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  44.19 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  32.74 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  38.04 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  34.13 
 
 		 167 aa  88.6  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  29.34 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  47.83 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  33.93 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  38.73 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  36.09 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  78.38 
 
 		 56 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  31.61 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  34.71 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3602  membrane protein of unknown function UCP014873  32.52 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  25.27 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  35.88 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0771  membrane protein of uknown function UCP014873  33.02 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0854213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>