48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1389 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  348  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  54.82 
 
 
176 aa  185  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  57.83 
 
 
173 aa  185  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  63.86 
 
 
179 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  59.04 
 
 
170 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  56.32 
 
 
174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  49.71 
 
 
182 aa  163  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  53.61 
 
 
202 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  53.61 
 
 
232 aa  160  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  53.01 
 
 
176 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  53.14 
 
 
206 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  47.67 
 
 
166 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  47.67 
 
 
166 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  50.6 
 
 
172 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  43.98 
 
 
177 aa  135  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  43.98 
 
 
177 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  50 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  51.23 
 
 
173 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  42.29 
 
 
172 aa  120  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  42.42 
 
 
301 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  48.08 
 
 
193 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  45.24 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  40.61 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  40.61 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  42.26 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  41.04 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  49.71 
 
 
165 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  36.75 
 
 
172 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  43.83 
 
 
168 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  41.82 
 
 
166 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  37.58 
 
 
163 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  45.78 
 
 
173 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  34.29 
 
 
167 aa  97.4  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  33.54 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  30.11 
 
 
168 aa  85.1  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  30.36 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  45.05 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  32.73 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  38.95 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  28.11 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  34.91 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  34.29 
 
 
249 aa  64.3  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  78.38 
 
 
56 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  35.33 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  29.59 
 
 
162 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3602  membrane protein of unknown function UCP014873  25.61 
 
 
174 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0771  membrane protein of uknown function UCP014873  29.92 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  26.35 
 
 
160 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.527907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>