49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1506 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  100 
 
 		 164 aa  323  9e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  56.6 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  56.6 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  56.13 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  56.13 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  58.02 
 
 		 172 aa  174  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  58.49 
 
 		 187 aa  174  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  58.49 
 
 		 172 aa  173  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  62.34 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  51.81 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  48.19 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  55 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  57.72 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  50.6 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  49.38 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  46.39 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  56.13 
 
 		 173 aa  147  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  62.03 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  49.7 
 
 		 202 aa  146  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  49.7 
 
 		 232 aa  147  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  46.88 
 
 		 301 aa  137  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  52.66 
 
 		 179 aa  137  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  54.44 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  49.7 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  44.91 
 
 		 173 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  46.15 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  51.28 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  42.31 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  42.31 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  38.12 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  39.75 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  49.4 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  39.1 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  39.74 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  63.64 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  35.9 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  32.28 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  42.5 
 
 		 249 aa  97.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  44.94 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  32.92 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  45.62 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  41.25 
 
 		 163 aa  90.9  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  36.36 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  29.35 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3602  membrane protein of unknown function UCP014873  32.35 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0771  membrane protein of uknown function UCP014873  35.54 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  32.48 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3580  hypothetical protein  28.77 
 
 		 213 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  48.65 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>