45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1820 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  100 
 
 
162 aa  323  4.0000000000000003e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  45.91 
 
 
168 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  44.03 
 
 
163 aa  138  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  35.19 
 
 
167 aa  97.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  34.57 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  39.62 
 
 
166 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  39.62 
 
 
166 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  41.29 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  34.18 
 
 
168 aa  90.9  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  32.93 
 
 
163 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  34.78 
 
 
163 aa  90.5  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  34.78 
 
 
163 aa  90.5  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  34.73 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  32.93 
 
 
176 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  38.61 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  35.22 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  33.96 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  36.42 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  35.9 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  36.13 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  35.22 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  31.36 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  26.16 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  37.5 
 
 
165 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  31.9 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  28.99 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  33.54 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  30.63 
 
 
301 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  30.25 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  34.13 
 
 
179 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  33.74 
 
 
173 aa  60.8  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  29.05 
 
 
197 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  37.74 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  31.93 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  30.77 
 
 
232 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  30.77 
 
 
202 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  35.16 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  32.89 
 
 
193 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  30.23 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  30.18 
 
 
206 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  29.68 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  30.82 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0771  membrane protein of uknown function UCP014873  28.91 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0854213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>